Preview

Фитосанитария. Карантин растений

Расширенный поиск

Диагностика бегомовирусов методом ПЦР

Полный текст:

Аннотация

Род Begomovirus включает более 190 видов вирусов, являющихся вредоносными патогенами овощных и полевых культур. Широко распространенный в Европе бегомовирус желтой курчавости листьев томата (Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV) является карантинным объектом для Российской Федерации, ЕАЭС и ЕОКЗР. Идентификация бегомовирусов до видового уровня сопряжена с определенными трудностями, обусловленными высокой идентичностью их генома. В статье приводятся результаты испытания 19 пар универсальных и специфических праймеров для диагностики бегомовирусов: вируса желтой курчавости листьев томата TYLCV, вируса желтой курчавости листьев томата Сардиния (Tomato yellow leaf curl Sardinia virus, TYLCSV) и Нью-Дели вируса курчавости листьев томата (Tomato leaf curl New Delhi virus, ToLCNDV) методами классической ПЦР и ПЦР в реальном времени.

Об авторах

Е. Н. Лозовая
ФГБУ «ВНИИКР»
Россия

научный сотрудник отдела аспирантуры



Ю. Н. Приходько
ФГБУ «ВНИИКР»
Россия

к. с.-х. н., ведущий научный сотрудник НМОВБ



Т. С. Живаева
ФГБУ «ВНИИКР»
Россия

научный сотрудник НМОВБ



Ю. А. Шнейдер
ФГБУ «ВНИИКР»
Россия

к. б. н., и. о. заместителя директора



Список литературы

1. Accotto G.P., Noris E. Detection methods for TYLCV and TYLCSV / H. Crosnek (ed.). Tomato yellow leaf curl virus disease // Springer. – 2007. – P. 241–249.

2. Accotto G.P., Navas-Castillo J., Noris E., Moriones E., Louro D. Typing of tomato yellow leaf curl viruses in Europe // European Journal of Plant Pathology. – 2000. – Vol. 106, No. 2. – P. 179–186.

3. Anfoka G.H., Abhary M.K., Nakhla M.K. Molecular identification of species of the Tomato yellow leaf curl virus complex in Jordan // Journal of Plant Pathology. – 2005. – Vol. 87, No. 1. – P. 65–70.

4. Atzmon G., van Oss H., Czosnek H. PCR amplification of Tomato yellow leaf curl virus DNA from squashes of plants and whitefly vectors: application to the study of TYLCV acquisition and transmission // European Journal of Plant Pathology. – 1998. – Vol. 104, No. 2. – P. 189–194.

5. Brown J.K., Zerbini F.M., Navas-Castillo J., Moriones E., Ramos-Sobrinho R., Silva J.C.F., Fiallo-Olivé E., Briddon R.W., Hernández-Zepeda C., Idris A., Malathi V.G., Martin D.P., Rivera-Bustamante R., Ueda S., Varsani A. Revision of Begomovirus taxonomy based on pairwise sequence comparisons // Archives of Virology. – 2015. – Vol. 160. – P. 1593–1619.

6. CABI, 2020. – URL: https://www.cabi.org.

7. Deng D., McGrath P.F., Robinson D.J., Harrison B.D. Detection and differentiation of whitefly transmitted geminiviruses in plants and vector insects by the polymerase chain reaction with degenerate primers // Annals of Applied Biology. – 1994. – Vol. 125. – P. 327–336.

8. EFSA, 2011. Scientific opinion on the pest categorisation of Tomato yellow leaf curl virus and related viruses causing tomato yellow leaf curl disease in Europe. EFSA Panel on Plant Health // EFSA Journal. – 2014. – Vol. 12, No. 10. – 27 pp.

9. El-gaied L.F., Salama M.I., Salem A.M., El-deen A.F., Abdallah A. Molecular and serological studies on a plant virus affecting strawberry // Arab. J. Biotech. – 2008. – Vol. 11. – P. 303–314.

10. EPPO. Tomato yellow leaf curl and Tomato mottle Begomoviruses. Diagnostics / EPPO Standard PM 7/50 (1) // Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. – 2005. – Vol. 35. – P. 319–325.

11. EPPO Global Database, 2020. – URL: https://gd.eppo.int.

12. Fortes I.M., Sánchez-Campos S., Fiallo-Olivé E., Díaz Pendón J.A., Navas-Castillo J., Moriones E. A novel strain of Tomato leaf curl New Delhi virus has spread to the Mediterranean basin // Viruses. – 2016. – Vol. 8, No. 307. – DOI: 10.3390/v8110307.

13. Garcia-Andres S., Monci F., Navas-Castillo J., Moriones E. Begomovirus genetic diversity in the native plant reservoir Solanum nigrum: Evidence for the presence of a new virus species of recombinant nature // Virology. – 2006. – Vol. 350, No. 2. – P. 433–442.

14. Gorsane F., Gharsallah-Chouchene S., Nakhla M.K., Fekih-Hassan I., Maxwell D.P., Marrakchi M., Fakhfakh H. Simultaneous and rapid differentiation of members of the Tomato yellow leaf curl virus complex by multiplex PCR // Journal of Plant Pathology. – 2005. – Vol. 87, No. 1. – P. 43–48.

15. Monci F., Sánchez-Campos S., Navas-Castillo J., Moriones E. A natural recombinant between the geminiviruses Tomato yellow leaf curl Sardinia virus and Tomato yellow leaf curl exhibits a novel pathogenic phenotype and is becoming prevalent in Spanish populations // Virology. – 2002. – Vol. 303, No. 2. – P. 317–326.

16. Navas-Castillo J., Sánches-Campos S., Díaz J.A., Sáez-Alonso E., Moriones E. First report of Tomato yellow leaf curl virus Is in Spain: coefistence of two different geminiviruses in the same epidemic outbreak // Plant Disease. – 1997. – Vol. 81, No. 12. – P. 1461.

17. Navas-Castillo J., Sánchez-Campos S., Díaz J.A., Sáez-Alonso E., Moriones E. Tomato yellow leaf curl virus-IS causes a novel disease of common bean and severe epidemics in tomato in Spain // Plant Disease. – 1999. – Vol. 83, No. 1. – Р. 29–32.

18. Navas-Castillo J., Sánchez-Campos S., Noris E., Louro D., Accotto G.P., Moriones E. Natural recombination between Tomato yellow leaf curl virus-Is and Tomato leaf curl virus // Journal of General Virology. – 2000. – Vol. 81. – P. 2797–2801.

19. Papayiannis L.C., Katis N.I., Idris A.M., Brown J.K. Identification of weed hosts of Tomato yellow leaf curl virus in Cyprus // Plant Disease. – 2011. – Vol. 95, No. 2. – P. 120–125.

20. Pellegrin F., Mnari-Hattab M., Tahiri A., Dalleau- Clouet C., Peterschmitt M., Bonato O. First report of simultaneous presence of Tomato yellow leaf curl Sardinia virus and Tomato yellow leaf curl Israel virus infecting crops and weeds in Tunisia // Journal of Plant Pathology. – 2008. – Vol. 90, No. 1. – P. 145.

21. Pico B., Díez M. J., Nuez F. Improved diagnostic techniques for Tomato yellow leaf curl virus in tomato breeding programs // Plant Disease. – 1999. – Vol. 83, No. 11. – P. 1006–1012.

22. Ruiz M.L., Simón A., Velasco L., García M.C., Janssen D. First report of Tomato leaf curl New Delhi virus infecting tomato in Spain // Plant Disease. – 2015. – Vol. 99, No. 6. – P. 894. – URL: http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-10-14-1072-PDN.


Для цитирования:


Лозовая Е.Н., Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А. Диагностика бегомовирусов методом ПЦР. Фитосанитария. Карантин растений. 2020;1(2):41-54.

For citation:


Lozovaia E.N., Prikhodko Y.N., Zhivaeva T.S., Shneyder Y.A. Diagnosis of begomoviruses by PCR. Plant Health and Quarantine. 2020;1(2):41-54.

Просмотров: 14


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.