Симптоматология российских изолятов вируса шарки слив

Вирус шарки (оспы) слив (Plum pox virus, PPV) является самым вредоносным вирусным патогеном косточковых плодовых культур. PPV характеризуется высокой генетической вариабельностью и его мировая популяция подразделяется на 10 штаммов, представляющих собой монофилетические группы генетически близкородственных изолятов. Характерной особенностью популяции вируса шарки слив в Российской Федерации является наличие эндемичных штаммов и самое высокое в мире генетическое разнообразие, обусловленное присут­ствием 7 штаммов этого вируса (C, D, M, Rec, W, CR и CV) из 10 известных. Штаммы PPV различаются по антигенным и эпидемиологическим свойствам, кругу хозяев, географической распространенности и патогенности для различных видов косточковых культур. Вирус шарки слив вызывает на листьях и плодах косточковых культур различные типы симптомов, некоторые из которых являются достаточно видоспецифичными и могут иметь важное диагностическое значение при проведении обследований. Бессимптомные инфекции для PPV не характерны, но степень выраженности симптомов может существенно варьироваться в зависимости от вида растенияхозяина, штамма вируса, сезона и климатических условий. Для диагностики PPV разработаны надежные иммунохимические и молекулярные методы анализа, однако диагностика по симптомам по-прежнему является достаточно эффективным и недорогим способом первичного выявления растений, зараженных этим вирусом. В статье приводится анализ многолетних наблюдений по симптоматологии основных штаммов вируса шарки слив, распространенных в Российской Федерации. Констатировано, что наиболее легко диагностируемыми на всех косточковых культурах являются симптомы изолятов штамма D. Симптомы изолятов штамма W, как правило, маскируются во второй половине вегетационного сезона. Симптомы изолятов штаммов C и CR более интенсивно развиваются на корневой поросли растений вишни, и менее – на плодоносящих деревьях. Определяющее значение для эффективного выявления симптомов вируса шарки слив имеет проведение обследований в оптимальные сроки, которые приходятся на поздневесенний и раннелетний период.

1. Закубанский А.В., Шевелева А.А., Чирков С.Н. Молекулярно-биологические свойства новых изолятов вируса оспы сливы штамма Winona // Вестник Московского университета. Серия. 16. Биология. 2016. № 2. С. 8–12.

2. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А. Скрининговые методы выявления комплекса штаммов вируса шарки слив (PPV) // Садоводство и виноградарство. 2019. №1. С. 36–42.

3. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Мазурин Е.С. Выявление нового штамма вируса шарки сливы на вишне в Поволжском регионе // Плодоводство и ягодоводство России (сборник науч. трудов ВСТИСП. М. 2012. Т.XXIX, часть 2. С.108–114.

4. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Мазурин Е.С., Соколова Е.Е. Выявление штамма Winona вируса шарки слив (PPV) на косточковых культурах в Российской Федерации // Плодоводство и ягодоводство России (сборник науч. трудов ВСТИСП. М. 2012а. Т.XXX. С. 382–388.

5. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Морозова О.Н. Шарка на вишне в Российской Федерации: распространенность, диагностика, штаммы вируса// Биоресурсы и вирусы: Материалы VII международной конференции 10–13 сентября 2013 г. Киев. 83 с.

6. Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Морозова О.Н., Мазурин Е.С. Выявление в Российской Федерации нового штамма вируса шарки слив C herry R ussian (PPV-CR) // Карантин растений. 2013. № 2. С. 18–33.

7. Приходько Ю.Н., Мазурин Е.С., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., Соколова Е.Е. Изучение штаммов вируса шарки сливы. Защита и карантин растений. 2011. № 11. С. 29–32.

8. Чирков С.Н., Приходько Ю.Н. Генетическое разнообразие и структура популяции вируса оспы (шарки) сливы в России // Сельскохозяйственная Биология. 2015. Т.50. №5. С. 529–539.

9. Cambra M., Boscia D., Myrta A., Llacer G. Plum pox virus and estimated cost asociated with Sharka disease // EPPO Bull. 2006. Vol. 36. P. 202–204.

10. Candresse T., Macquaire G., Lanneau M., Bousalem M., Quiot-Douine L., Quiot J.B., Dunez J. Analysis of plum pox virus variability and development of strain-specific PCR assays // Acta Horticulturae. 1995. № 386. – Р. 357–369.

11. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A. Detection and p artial m olecular c haracterization o f a typical plum pox virus isolates from naturally infected sour cherry // Arch. Virol. 2013. Vol. 158. P. 1383–1387.

12. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Kudryavtseva A ., M itrofanova I . M olecular c haracterization of Plum pox virus Rec isolates from Russia suggests a new insight into evolution of the strain // Virus Genes. 2018a. Vol. 54 (2). P. 328–332.

13. Chirkov S., Ivanov P., Sheveleva A., Kudryavtseva A., Prikhodko Y., Mitrofanova I. Occurrence and characterization of plum pox virus strain D isolates from European Russia and Crimea // Archives of Virology. 2016. Vol. 161. Р. 425–430.

14. Chirkov S., Sheveleva A., Gasanova T., Kwon D., Sharko F., Osipov G. New cherry-adapted Plum pox virus phylogroups discovered in Russia // Plant Disease. 2022. Vol. 106. P. 2591–2600.

15. Chirkov S., Sheveleva A., Ivanov P., Zakubanskiy A. Analysis of genetic diversity of Russian sour cherry Plum pox virus isolates provides evidence of a new strain // Plant Disease. 2018. Vol. 102. P. 569– 575.

16. Clemente – Moreno M.J., Hernandez J.A., Diaz Vivancos P. Sharka: how do plants respond to Plum pox virus infection? // J. Exp. Bot. 2015. Vol. 66. P. 25–35.

17. Glasa M., Candresse T. Partial sequence analysis of an atypical Turkish isolate provides further information on the evolutionary history of Plum pox virus (PPV) // Virus Research. 2005. Vol. 108. P. 199–206.

18. Glasa M., C andresse T . P lum p ox v irus (Potyviridae) // Reference Module in Life Sciences. – 2020. – doi: 10.1016/B978–0-12–809633-B.21242–9.

19. Glasa M., Malinowski T., Predajňa L., Pupola N., Dekena D., Michalczuk L., Candresse T. Sequence variability, recombination analysis, and specific detection of the W strain of Plum pox virus // Phytopathology. 2011. Vol. 101. P. 980–985.

20. Glasa M., Palkovics L., Komínek P., Labonne G., Pittnerova S., Kudela O., Candresse T., Šubr Z. Geographically and temporally distant natural recombinant isolates of Plum pox virus (PPV) are genetically very similar and form a unique PPV subgroup // Journal of General Virology. 2004. Vol. 85. P. 2671–2681.

21. Glasa M., Prichodko Y., Z hivaeva T., S hneider Y., Predajňa L., Šubr Z., Candresse T. Complete and partial genome sequences of the unusual Plum pox virus (PPV) isolates from sour cherry in Russia suggest their classification to a new PPV strain // Proceedings of the 22nd International Conference on Virus and Other Transmissible Diseases of Fruit Crops (ICVF). Rome, June 3–8, 2012. 235 p.

22. Glasa M., Prikhodko Y., Predajňa L., N agyová A., Shneyder Y., Zhivaeva T., Šubr Z., Cambra M., Candresse T. Characterization of sour cherry isolates of Plum pox virus from the Volga Basin in Russia reveals a new cherry strain of the virus // Phytopathology. – 2013. Vol. 103, № 9. – Р. 972–979.

23. Glasa М., Shneyder Y., Predajna L., Zhivaeva T., P rikhodko Y. C haracterization o f R ussian Plum pox virus isolates provides further evidence of a low molecular heterogeneity within the PPV-C strain // Journal of Plant Pathology. 2014. Vol. 96, № 3. Р. 597–601.

24. Hajizadeh M., Gibbs A.J., Amirnia F., Glasa M. The global phylogeny of Plum pox virus is emerging // Journal of General Virology. 2019. V ol. 100. P. 1457–1468.

25. James D., Varga A. Nucleotide sequence analysis of Plum pox virus isolate W3174: Evidence of a news train // Virus Research. 2004. V ol. 110. P. 143–150.

26. James D., Varga A., Sanderson D. Genetic diversity of Plum pox virus: strains, disease and related challenges for control // Canadian J. Plant Pathol. 2013. Vol. 35. P. 431–441.

27. Levy L., Hadidi A. A. Simple and rapid method for processing tissue infected with Plum pox potyvirus for use with specific 3’-non-coding region RT-PCR assays // EPPO Bull. 1994. Vol. 24. P. 595–604.

28. Nemchinov L ., Hadidi A. S pecific o ligonucleotide primers for the direct detection of plum pox potyvirus – cherry subgroup // J. Virol. Methods. 1998. Vol. 70. P. 231–234.

29. Prikhodko Y., Shneider Y., Zhivaeva T., Morozova O. Distribution and some biological and molecular characterization of a new PPV-CR strain//2nd Int. Symp. on Plum pox virus. – Olomouc, September 3–6, 2013a. P. 25.

30. Prikhodko Y., Shneider Y., Zhivaeva T., Morozova O. P PV i n R ussia: D istribution a nd s trains // Proceedings of the 2nd Int. Symp. on Plum pox virus. September 3–6, 2013, Olomouc, P. 26.

31. Prikhodko Y., Shneyder Y., Zhivaeva T., Morozova O. The PPV-W strain in Russia: distribution and identification// B ook o f A bstracts 3rd I nternational Symposium on Plum pox virus. May 9–13, 2016, Antalya, Turkey, P. 45.

32. Sheveleva A., Ivanov P., Prihodko Y., James D., Chirkov S. Occurrence and genetic diversity of Winonalike Plum pox virus isolates in Russia // Plant Disease. 2012. Vol. 96 (8). P. 1135–1142.

33. Sheveleva A., Kudryavtseva A., Speranskaya A., Belenikin M., Melnikova N., Chirkov S. Complete genome sequence of a novel Plum pox virus strain W isolate determined by 454 pyrosequencing // Virus Genes. 2013. Vol. 47. P. 385–388.

34. Shneyder Y., Thihomirova M., Morozova O., Zhivaeva T., Prikhodko Y. The first detection of Plum pox virus in Western Siberia // Proceedings of the 24th International C onference o n V irus a nd O ther G raft Transmissible Diseases of Fruit Crops, Thessaloniki, Greece, 2017, P. 120.

35. Subr Z., Pittnerova S., Glasa M. A simplified RT-PCR-based detection of recombinant Plum pox virus isolates // Acta Virologica. 2004. Vol. 48. P. 173–176.

36. Szemes M., Kalman M., Verta A., Boscia D., Nemrth M., Kolber M., Dorgai L. Integrated RT-PCR/ nested PCR diagnosis for differentiating between subgroups of plum pox virus // Journal of Virological Methods. 2001. Vol. 92. P. 165–175.

37. Wetzel T., Candresse T., Ravelonandro M., Dunez J. A polymerase chain reaction assay adapted to plum pox potyvirus detection // Journal of Virological Methods. 1991. Vol. 33. P. 355–365.

38. EPPO, 2024. Plum pox virus // EPPO datasheets on pests recommended for regulation URL: https://gd.eppo.int.