Диагностика вируса мозаики пепино (PepMV)

Вирус мозаики пепино (Pepino mosaic virus, PepMV) – представитель рода Potexvirus, является карантинным объектом для стран ЕАЭС, ЕОКЗР и ряда стран различных континентов. Основные растения-хозяева вируса – томат и баклажан, но также он поражает перец, картофель и пепино. Потери урожая плодов томата в результате заражения PepMV могут достигать 30-40%. Вирус мозаики пепино характеризуется многообразием путей распространения и способен длительное время сохраняться в растительных остатках, почве, воде, растворах для гидропоники и на различных инертных поверхностях. Важное значение в распространении PepMV имеет семенная инфекция. С зараженными семенами вирус способен распространяться на новые территории, а единичные зараженные семена в партии способны в процессе вегетации нанести колоссальный ущерб производителям овощных культур. Мировая популяция вируса мозаики пепино состоит из пяти генетически различающихся штаммов, что затрудняет его диагностику с использованием молекулярных методов. Целью проводимых исследований являлся поиск праймеров, позволяющих осуществлять универсальное выявление изолятов всех штаммов вируса мозаики пепино и праймеров, позволяющих проводить высокоспецифичное определение штаммовой принадлежности выявляемых изолятов этого вируса. По результатам испытания 13 пар праймеров определены три пары праймеров для универсального выявления всех штаммов PepMV и две пары праймеров для высокоспецифичного определения штаммов Eu/Peruvian. Констатирована необходимость дальнейшего скрининга праймеров для высокоспецифичного определения штаммов CH1/US1 и СН2 PepMV.

1. Шнейдер Ю.А., Каримова Е.В., Приходько Ю.Н., Лозовая Е.Н., Живаева Т.С. Вирусы томата, особо опасные для овощеводства России. // Картофель и овощи. – 2021. – № 6. – С. 3–8.

2. Candresse T., Marais A., Faure C., Dubrana M.P., Gombert J., Bendahmane A. Multiple coat protein mutations abolish recognition of Pepino mosaic potexvirus (PepMV) by the potato Rx resistance gene in transgenic tomatoes// MPMI. – 2010. – Vol. 23 (4). – P. 376–383.

3. Córdoba-Sellés M.C., García-Rández A., Alfaro-Fernández A., Jordá-Gutiérrez C. Seed transmission of Pepino mosaic virus and efficacy of tomato seed disinfection treatments // Plant Disease. – 2007. – Vol. 91 (10). – P. 1250–1254.

4. EPPO, 2013. PM 7/113 (1) Pepino mosaic viruS. Diagnostics // Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. – 2013. – Vol.43 (1). – P.94–104.

5. Gutiérrez-Aguirrea I., Mehlea N., Delic D., Grudena K., Mumford R., Ravnikar M. Real-time quantitative PCR based sensitive detection and genotype discrimination of Pepino mosaic virus // Journal of Virological MethodS. – 2009. – Vol. 162. – P. 46–55.

6. Hanssen I.M., Mumford R., Blystad D.R., Cortez I., Hasiów-Ajaroszewska B., Hristova D., Pagán I., Pereira A.M., Peters J., Pospieszny H., Ravnikar M., Stijger I., Tomassoli L., Varveri C., Vlugt R.A.A, Nielsen S.L. Seed transmission of Pepino mosaic virus in tomato // European Journal of Plant Pathology. – 2010. – Vol. 126. – P. 2010–2020.

7. Jones R.A.C., Koenig R., Lesemann D.E. Pepino mosaic virus, a new potexvirus from pepino (Solanum muricatum) // Annals of Applied Biology. – 1980. – Vol. 94. – P. 61–68.

8. Lacasa A., Guerrero M.M., Hita I., Martínez M.A., Jordá C., Bielza P., Contreras J., Alcázar A., Cano A. Implication of bumble bees (Bombus spp.) on Pepino mosaic virus (PepMV) spread on tomato crops // Plagas. – 2003. –Vol.29. – P. 393–403.

9. Ling K.-S., Li R. and Bledsoe M. Pepino mosaic virus genotype shift in North America and development of a loop-mediated isothermal amplification for rapid genotype identification // Virology Journal. – 2013. – Vol. 10. – P. 117–124.

10. Ling K.-S., Wechter W.P., Jordan R. Development of a one-step immunocapture real-time TaqMan RT-PCR assay for the broad spectrum detection of Pepino mosaic virus// Journal of Virological Methods. – 2007. – Vol. 144. – P. 65–72.

11. Mehle N., Gutiérrez-Aguirre I., Prezelj N., Delić D., Vidic U., Ravnikar M. Survival and transmission of Potato virus Y, Pepino mosaic virus, and Potato spindle tuber viroid in water // Appl. Environ. Microbiol. – 2014. – Vol. 80 (4). – P. 1455–1462.

12. Moerkens R., Van Damme V., Berckmoes E., Ortega-Parra N. High population densities of Macrolophus pygmaeus on tomato plants can cause economic fruit damage: Interaction with Pepino mosaic virus? // Pest Management Science. – 2015. – Vol.72 (7). – P. 1350–1358.

13. Mumford R.A., Jones R.A.C. Pepino mosaic virus / CMI/AAB Descriptions of Plant ViruseS. – 2005. – №411. – 9 sp.

14. Mumford R.A., Metcalfe E.J. The partial sequencing of the genomic RNA of a UK isolate of Pepino mosaic virus and the comparison of the coat protein sequence with other isolates from Europe and Peru // Arch Virol. – 2001. – Vol. 146 (12). – P. 2455–2460.

15. Pagán I., Córdoba-Sellés M.C., MartínezPriego L., Fraile A., Malpica J.M., Jordá C., García-Arenal F. Genetic structure of the population of Pepino mosaic virus infecting tomato crops in Spain // Phytopathology. – 2006. – Vol.96. – P.274–279.

16. Shipp J.L., Buitenhuis R., Stobbs L., Wang K., Kim W.S., Ferguson G. Vectoring of Pepino mosaic virus by bumble bees in tomato greenhouses // Annals of Applied Biology. – 2008. – Vol.153. – P. 149–155.

17. Shneyder Y., Morozova O., Tikhomirova M., Karimova E., Prikhodko Y. Methods of diagnostic of Pepino mosaic virus in Russian Federation / Abstracts of the V International Symposium on Tomato Diseases: Perspectives and Future Directions in Tomato Protection. Malaga, Spain. – 2016. – P. 91.

18. Souiri A., Zemzami M., Khataby K., Laatiris H., Amzazi S., Ennaji M.M. A simple, rapid and efficient method of Pepino mosaic virus RNA isolation from tomato fruit // J Plant Pathol Microbiol. – 2017. – 8: 395. doi: 10.4172/2157-7471.1000395.

19. Stobbs L.W., Greig N., Weaver S., Shipp L., Ferguson G. The potential role of native weed species and bumble bees (Bombus impatiens) on the epidemiology of Pepino mosaic virus // Canadian Journal of Plant Pathology. – 2010. – Vol. 31. – P. 254–261.

20. EPPO, 2024. Pepino mosaic viruS. EPPO datasheets on pests recommended for regulation. https://gd.eppo.int (дата обращения 2024-03-14).

21. Groen Agro Control Lab., 2013. Validation of qRT-PCR-assay to identify mild variantsof PepMV and semi-quantify the ratio of mild variants relative to total PepMV. https://publications.gc.ca/collections/collection_2019/sc-hc/h113-9/H113-9-2019-10-eng.pdf (дата обращения 2024-02-14).