phytosanitaryФитосанитария. Карантин растенийPlant Health and Quarantine2782-327X10.69536/FKR.2021.49.59.001phytosanitary-81Research ArticleНАУЧНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯSCIENTIFIC RESEARCHО некоторых пикнидиальных грибах на вегетирующем картофеле в Нечерноземье средней полосы РоссииOn some pycnidial fungi on growing potatoes in the Nonchernozem region of Central Russiahttps://orcid.org/0000-0002-1613-1764КопинаМ. Б.KopinaM. B.

Копина Мария Борисовна - кандидат сельскохозяйственных наук, старший научный сотрудник  – начальник научно-методического отдела микологии и  гельминтологии ФГБУ ВНИИКР.

Р. п. Быково, Раменское, Московская обл.

Maria Kopina - PhD in agricultural sciences, senior researcher, head of the Scientific and Methodological Department for Mycology and Helminthology, FGBU VNIIKR.

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

kopina.mariya@vniikr.ruУвароваД. А.UvarovaD. A.

Уварова Дарья Анатольевна - младший научный сотрудник научного отдела молекулярно-генетических методов диагностики ФГБУ ВНИИКР.

Р. п. Быково, Раменское, Московская обл.

Daria Uvarova - junior researcher, Research Department for Molecular Genetic Methods of Diagnosis, FGBU VNIIKR.

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

darya.uvarova.93@mail.ruШухинД. И.ShukhinD. I.

Шухин Дмитрий Игоревич - младший научный сотрудник научно-методического отдела микологии и  гельминтологии ФГБУ ВНИИКР.

Р. п. Быково, Раменское, Московская обл.

Dmitry Shukhin - junior researcher, Scientific and Methodological Department for Mycology and Helminthology, FGBU VNIIKR.

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

dmitriq.shukhin@gmail.comГорловаЛ. М.GorlovaL. M.

Горлова Любовь Михайловна - студент-магистрант биологического факультета ФГБОУ ВО СПбГУ.

Санкт-Петербург

Lyubov Gorlova - MS student, Biology Department, FGBOU VO SPbGU.

Saint Petersburg

lubowgorlova@gmail.comЧалаяН. А.ChalayaN. A.

Чалая Надежда Александровна – кандидат сельскохозяйственных наук, старший научный сотрудник отдела генетических ресурсов картофеля.

СанктПетербург

Nadezhda Chalaya - PhD in agricultural sciences, senior researcher, Department of Potato Genetic Resources.

St. Petersburg

n.chalaya@vir.nw.ruФГБУ Всероссийский центр карантина растений (ФГБУ ВНИИКР)РоссияFGBU All-Russian Plant Quarantine Center (FGBU VNIIKR)Russian FederationФГБОУ ВО Санкт-Петербургский государственный университет (ФГБОУ ВО СПбГУ)РоссияFGBOU VO St. Petersburg State University (FGBOU VO SPbGU)Russian FederationФИЦ Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова (ВИР)РоссияFederal Research Center N.I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR)Russian Federation202115092021032739Copyright © Копина М.Б., Уварова Д.А., Шухин Д.И., Горлова Л.М., Чалая Н.А., 20212021Копина М.Б., Уварова Д.А., Шухин Д.И., Горлова Л.М., Чалая Н.А.Kopina M.B., Uvarova D.A., Shukhin D.I., Gorlova L.M., Chalaya N.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://phytosanitary.vniikr.ru/jour/article/view/81

В статье рассматриваются фомоидные грибные возбудители, ассоциированные с вегетирующим картофелем в Московской и Ленинградской областях и выявленные в период 2019–2020 гг. Представлены биологические особенности пикнидиальных грибов, особенности проявления симптомов, описаны диагностически значимые культурально-морфологические признаки. В результате проведенных исследований на пораженных листьях картофеля из пикнидиальных грибов были идентифицированы представители родов Didymella, Neoascochyta, Phoma, Boeremia. В период вегетации доминирующее положение из непикнидиальных грибов в 80% исследуемых образцов, отобранных в Московской области, занимали виды рода Alternaria. Гриб Boeremia foveate (Foister) Aveskamp, Gruyter & Verkley был выделен в единичном случае при обследовании посадок картофеля в Пушкинском районе Санкт-Петербурга. В исследованных растениях также встречались виды, нехарактерные для картофеля: однократно из пораженных листьев были выделены виды Neoascochyta exitialis (Morini) Q. Chen & L. Cai и Didymella pinodella (L.K. Jones) Q. Chen & L. Cai. В результате проведенных исследований выделено и идентифицировано 10 видов фомоидных патогенных грибов.Полученные изоляты внесены в микологическую коллекцию ФГБУ «ВНИИКР» для изучения морфологических особенностей комплекса микромицетов картофеля, присутствие которых возможно совместно с карантинными вредными организмами.

The article studies phomoid fungal pathogens associated with growing potatoes in Moscow Oblast and Leningrad Oblast identified in the period 2019–2020. Biological characteristics of pycnidial fungi and peculiarities of infestation symptom are presented, diagnostically significant cultural and morphological characters are described. As a result of the research, representatives of the genera Didymella, Neoascochyta, Phoma, Boeremia were identified from pycnidial fungi on diseased potato leaves. During the growing season, the dominant position among non-pycnidial fungi in 80% of the studied samples taken in Moscow Oblast was formed by species of the genus Alternaria. The fungus Boeremia foveata (Foister) Aveskamp, Gruyter & Verkley was isolated in a single case during a survey of potato plantings in the Pushkin district of St. Petersburg. The studied plants also contained species uncharacteristic for potatoes: from the affected leaves, the species Neoascochyta exitialis (Morini) Q. Chen & L. Cai и Didymella pinodella (L.K. Jones) Q. Chen & L. Cai were isolated once. As a result of the research, 10 species of phomoid pathogenic fungi were isolated and identified. The obtained isolates were deposited in the mycological collection of the FGBU “VNIIKR” to study the morphological features of the complex of potato micromycetes, the presence of which is possible together with quarantine pests.

фомозкарантинный вредный организмгрибные возбудителипятнистость листьевфитопатогенphomosisquarantine pestfungal pathogensleaf spotphytopathogenReferencesВредные организмы, имеющие карантинное значение для Европы. – М.: Колос, 1996, 912 с.Pests of quarantine importance for Europe [Vrednyye organizmy, imeyushchiye karantinnoye znacheniye dlya Yevropy]. M.: Kolos, 1996, 912 pp. (in Russian).Гомжина М., Ганнибал Ф., 2017. Современная систематика грибов рода Phoma sensu lato. – Микология и фитопатология, № 51 (5): 268–275.Gomzhina M., Hannibal F. Modern systematics of the genus Phoma sensu lato [Sovremennaya sistematika gribov roda Phoma sensu lato]. Mycology and phytopathology, 2017; 51 (5): 268–275 (in Russian).Заверткина И. Биологические особенности сибирской популяции Phoma exiqua var. foveata и совершенствование системы защиты картофеля от фомоза: автореф. дис. ...канд. биол. наук. – Кинель, 2007, 19 с.Zavertkina I. Biological features of the Siberian population Phoma exiqua var. foveata and improvement of the system of protection of potatoes against phomosis [Biologicheskiye osobennosti sibirskoy populyatsii Phoma exiqua var. foveata i sovershenstvovaniye sistemy zashchity kartofelya ot fomoza]: extended abstract of Cand. Biol. Sci. Dissertation. Kinel, 2007: 19 (in Russian).Пидопличко Н. Грибы – паразиты культурных растений. Грибы несовершенные. Определитель. Т 2. – Киев: Наукова думка, 1977, 290 с.Pidoplichko N. Fungi – parasites of cultivated plants [Griby – parazity kulturnykh rasteniy]. Imperfect Fungi. Identification Key. V 2. Kiev, Naukova dumka, 1977; 290 pp. (in Russian).Пилипова Ю., Шалдяева Е., 2019. Мониторинг вредных организмов как основа фитосанитарной оптимизации агроэкосистем картофеля. – Инновации и продовольственная безопасность, № 1: 42–50.Pilipova Y., Shaldyaeva E. Monitoring of harmful organisms as the basis of phytosanitary optimization of agroecosystems potatoes [Monitoring vrednykh organizmov kak osnova fitosanitarnoy optimizatsii agroekosistem kartofelya]. Innovation and food security, 2019; 1: 42–50 (in Russian).Семенов А.Я., Абрамова Л., Хохряков М. Определитель паразитных грибов на плодах и семенах культурных растений – Л.: Колос, 1980, 302 с.Semenov A.Ya., Abramova L., Khokhryakov M. Identification keys to parasitic fungi on fruits and seeds of cultivated plants [Opredelitel parazitnykh gribov na plodakh i semenakh kulturnykh rasteniy] L. Kolos, 1980; 302 pp. (in Russian).Aveskamp M., Gruyter H., Woudenberg J., Verkley G., Crous P., 2010. Highlights of the Didymellaceae: A polyphasic approach to characterise Phoma and related pleosporalean genera. – Stud. Mycology, Vol. 65: 1–64.Aveskamp M., Gruyter H., Woudenberg J., Verkley G., Crous P. Highlights of the Didymellaceae: A polyphasic approach to characterise Phoma and related pleosporalean genera. Studies in Mycology, 2010; 65: 1–64.Boerema G., de Gruyter J., Noordeloos M., Hamers M. Phoma identification manual: differentiation of specific and infraspecific taxa in culture. – CABI Publishing, 2004, 470 p.Boerema G., de Gruyter J., Noordeloos M., Hamers M. Phoma identification manual: differentiation of specific and infra-specific taxa in culture. CABI Publishing, 2004, 470 p.Chen Q., Hou L., Duan W., Crous P., Cai L., 2017. Didymellaceae revisited. – Studies in Mycology, Vol. 87: 105–159.Chen Q., Hou L., Duan W., Crous P., Cai L. Didymellaceae revisited. Studies in Mycology, 2017; 87: 105–159.Chen Q., Zhang K., Zhang G., 2015. A polyphasic approach to characterise two novel species of Phoma (Didymellaceae) from China. – Phytotaxa, № 197: 267–281.Chen Q., Zhang K., Zhang G. A polyphasic approach to characterise two novel species of Phoma (Didymellaceae) from China. Phytotaxa, 2015; 197: 267–281.De Gruyter J., 2012. Revised taxonomy of Phoma and allied genera. http://library.wur.nl/WebQuery/wurpubs/429756.De Gruyter J. Revised taxonomy of Phoma and allied genera. 2012. http://library.wur.nl/WebQuery/wurpubs/429756.De Gruyter J., van Gent-Pelzer M., Woudenberg J., van Rijswick P., Meekes E., Crous P., Bonants P., 2012. The development of a validated real-time (TaqMan) PCR for detection of Stagonosporopsis andigena and S. crystalliniformis in infected leaves of potato and tomato. – European Journal of Plant Pathology, № 134: 301–313.De Gruyter J., van Gent-Pelzer M., Woudenberg J., van Rijswick P., Meekes E., Crous P., Bonants P. The development of a validated real-time (TaqMan) PCR for detection of Stagonosporopsis andigena and S. crystalliniformis in infected leaves of potato and tomato. European Journal of Plant Pathology, 2012; 134: 301–313.Farley J.D., 1976. Survival of Colletotrichum coccodes in soil. – Phytopathology, Vol. 66: 640–641.Farley J.D. Survival of Colletotrichum coccodes in soil. Phytopathology, 1976; 66: 640–641.Noordeloos M., de Gruyter J., van Eijk G., Roeijmans H., 1993. Production of dendritic crystals in pure cultures of Phoma and Ascochyta and its value as a taxonomic character relative to morphology, pathology and cultural characteristics. – Mycol. Res, № 97: 1343–1350.Noordeloos M., de Gruyter J., van Eijk G., Roeijmans H. Production of dendritic crystals in pure cultures of Phoma and Ascochyta and its value as a taxonomic character relative to morphology, pathology and cultural characteristics. Mycol. Res, 1993; 97: 1343–1350.Pest categorisation of Stagonosporopsis andigena. 2018. – EFSA Journal, 16 (10): 5441.Pest categorisation of Stagonosporopsis andigena. EFSA Journal, 2018; 16 (10): 5441.Food and Agriculture Organization (FAO). – URL: http://www.fao.org/home/ru/ (дата обращения: 01.07.2021).Food and Agriculture Organization (FAO). URL: http://www.fao.org/home/ru/ (last accessed: 01.07.2021).CABI Plantwise, 2021. – URL: https://www.plantwise.org (дата обращения: 15.06.2021).CABI Plantwise, 2021. URL: https://www.plantwise.org (last accessed: 15.06.2021).EPPO, 2021. EPPO Global Database. – URL: https://gd.eppo.int (дата обращения: 01.05.2021).EPPO, 2021. EPPO Global Database. URL: https://gd.eppo.int (last accessed: 01.05.2021).Indexfungorum, 2021. – URL: https http://www.indexfungorum.org (дата обращения: 01.06.2021).Indexfungorum, 2021. URL: https http://www.indexfungorum.org (last accessed: 01.06.2021).Groenewald J., Nakashima C., Nishikawa J., Shin H., Park J., Jama A., 2013. Species concepts in Cercospora: spotting the weeds among the roses. – Studies in Mycology, 75: 115–170.Groenewald J., Nakashima C., Nishikawa J., Shin H., Park J., Jama A. Species concepts in Cercospora: spotting the weeds among the roses. Studies in Mycology, 2013; 75: 115–170.Mycobank, 2021. MYCOBANK Database. – URL: https://www.mycobank.org (дата обращения: 15.06.2021).Mycobank, 2021. MYCOBANK Database. URL: https://www.mycobank.org (last accessed: 15.06.2021).White T., Bruns T., Lee S., Taylor J., 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. – In book: PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. – Academic Press, San Diego (US): 315–322.White T., Bruns T., Lee S., Taylor J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In book: PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. Academic Press, San Diego (US). 1990; 315–322.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.