phytosanitaryФитосанитария. Карантин растенийPlant Health and Quarantine2782-327X10.69536/FKR.2020.96.92.001phytosanitary-8Research ArticleНАУЧНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯSCIENTIFIC RESEARCHОптимизированный подход к выявлению нематод рода Heterodera и карантинного вида Heterodera glycinesOptimized Approach for the Detection of Heterodera spp. and the Quarantine Species Heterodera glycinesИвановА. В.IvanovA.

младший научный сотрудник лаборатории гельминтологии Испытательного лабораторного центра

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.

Junior Researcher of Helminthology Laboratory Testing Laboratory Center,

Bykovo, Ramenskoye, Moscow region

tonijons8@mail.ruСудариковаС. В.SudarikovaS.

старший научный сотрудник лаборатории гельминтологии Испытательного лабораторного центра

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.,

Senior Researcher of Helminthology Laboratory Testing Laboratory Center

Bykovo, Ramenskoye, Moscow region

sudarikovah@mail.ruХудяковаЕ. А.KhudyakovaE.

заведующая лабораторией гельминтологии Испытательного лабораторного центра, старший научный сотрудник

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.,

Head of Helminthology Laboratory Testing Laboratory Center

Bykovo, Ramenskoye, Moscow region

fer59@mail.ruФГБУ «Всероссийский центр карантина растений»РоссияAll-Russian Plant Quarantine CenterRussian Federation202001062021043039Copyright © Иванов А.В., Сударикова С.В., Худякова Е.А., 20212021Иванов А.В., Сударикова С.В., Худякова Е.А.Ivanov A., Sudarikova S., Khudyakova E.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://phytosanitary.vniikr.ru/jour/article/view/8

Проведены апробирование и оптимизация тестов на основе полимеразной цепной реакции с использованием коммерческих наборов реагентов российского производства для выделения и амплификации ДНК соевой цистообразующей нематоды Heterodera glycines Ichinohe в формате классической ПЦР. Подтверждена пригодность отечественных коммерческих наборов для данного исследования.

The approbation and optimization of PCR tests using Russian commercial reagents kits for the DNA extraction and amplification of the soybean cyst nematode Heterodera glycines Ichinohe in classic PCR format has been carried out. The suitability of Russian commercial kits for this study has been confirmed.

Карантин растенийсоевая цистообразующая нематода Heterodera glycines Ichinoheморфологические признакиморфометриямолекулярно-генетические методыполимеразная цепная реакция (ПЦР)секвенирование.Plant quarantinesoybean cyst nematode Heterodera glycines Ichinohemorphological characteristicsmorphometrymolecular genetic methodspolymerase chain reaction (PCR)sequencing.ReferencesEPPO Global Database, 2020. – URL: https://gd.eppo.int (дата обращения: 01.09.2020).EPPO Global Database, 2020. URL: https://gd.eppo.int (last accessed: 01.09.2020).Ichinohe M. 1952. On the soy bean nematode, Heterodera glycines n. sp., from Japan // Oyo-Dobutsugaku-Zasshi. – Vol. 17, No. 1–2. – P. 1–4.Ichinohe M. On the soy bean nematode, Heterodera glycines n. sp., from Japan. Oyo-Dobutsugaku-Zasshi. 1952; 17 (1–2): 1–4.Волкова Т.В. Соевая нематода (Tylenchida: Heteroderidae: Heterodera glycines) в Приморском крае. – Владивосток: Дальнаука, 2003. – 91 с.Volkova T.V. Soybean nematode (Tylenchida: Heteroderidae: Heterodera glycines) in the Primorsky Krai [Soyevaya nematoda (Tylenchida: Heteroderidae: Heterodera glycines) v Primorskom Krae]. Vladivostok: Dalnauka, 2003. 91 pp. (In Russian.)Qing Yu. Soybean Cyst Nematode (Heterodera glycines Ichinohe) // In: Soybean Physiology and Biochemistry / Prof. Hany El-Shemy (Ed.). – InTech, 2011. – 488 p.Qing Yu. Soybean Cyst Nematode (Heterodera glycines Ichinohe). In: Soybean Physiology and Biochemistry. Prof. Hany El-Shemy (Ed.). InTech, 2011. 488 p.Единый перечень карантинных объектов Евразийского экономического союза, утвержденный Решением Совета Евразийской экономической комиссии от 30.11.2016 № 158. С изменениями и дополнениями от 30.03.2018 (изменения от 02.05.2018 – Решение Совета Евразийской экономической комиссии от 30.03.2018 № 25). – 2018.Common List of Plant Quarantine Objects of the Eurasian Economic Union approved by the Decision of the Council of the Eurasian Economic Commission as of 30.11.2016 № 158. As amended and supplemented from 03/30/2018 (changes from 05/02/2018 – Decision of the Council of the Eurasian Economic Commission from 03/30/2018, No. 25). 2018. (In Russian.)Перечень карантинных объектов, утвержденный приказом Министерства сельского хозяйства Российской Федерации от 15.12.2014 № 501.The List of Quarantine Objects approved by order of the Ministry of Agriculture of the Russian Federation dated December 15, 2014, № 501. (In Russian.)Буторина Н.Н., Зиновьева С.В., Кулинич О.А. и др. Прикладная нематология / Ин-т паразитологии РАН. – Москва: Наука, 2006. – 350 с.Butorina N.N., Zinovieva S.V., Kulinich O.A. et al. Applied Nematology [Prikladnaya nematologiya]. RAS Institute of Parasitology. Moscow: Nauka, 2006. 350 p. (In Russian.)Официальный сайт компании «Синтол». – URL: https://www.syntol.ru (дата обращения: 03.09.2020).Syntol company official website. URL: https://www.syntol.ru (last accessed: 03.09.2020). (In Russian.)Официальный сайт компании «Евроген». – URL: http://evrogen.ru (дата обращения: 03.09.2020).Evrogen company official website. URL: http://evrogen.ru (last accessed: 03.09.2020). (In Russian.)Официальный сайт компании «АгроДиагностика». – URL: https://www.agrodiagnostica.ru (дата обращения: 03.09.2020).AgroDiagnostica company official website. URL: https://www.agrodiagnostica.ru (last accessed: 03.09.2020). (In Russian.)Официальный сайт компании «Диалат Лтд.». – URL: http://dialat.ru (дата обращения: 03.09.2020).Dialat Ltd. company official website. URL: http://dialat.ru (last accessed: 03.09.2020). (In Russian.)Hu M., Hoglund J. Mutation scanning analysis of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 reveals limited gene flow among bovine lungworm subpopulations in Sweden // Electrophoresis. – 2002. – Vol. 23, No. 19. – P. 3357–3363.Hu M., Hoglund J. Mutation scanning analysis of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 reveals limited gene flow among bovine lungworm subpopulations in Sweden. Electrophoresis. 2002; 23 (19): 3357–3363.МР ВНИИКР № 32-2015 «Методические рекомендации по выявлению и идентификации соевой цистообразующей нематоды Heterodera glycines (Ichinohe)».Subbotin S., Peng D., Moens M. A rapid method for the identification of the soybean cyst nematode Heterodera glycines using duplex PCR. Nematology. 2001; 3 (4): 365–371.СТО ВНИИКР 6.001-2010 «Картофельные цистообразующие нематоды Globodera rostochiensis (Woll.) Behrens и Globodera pallida (Stone) Behrens. Методы выявления и идентификации».MR VNIIKR № 32-2015 “Methodological recommendations on the detection and identification of the soybean cyst nematode Heterodera glycines (Ichinohe)”. (In Russian.)Сударикова С.В., Иванов А.В., Худякова Е.А. Совершенствование ПЦР-диагностики золотистой картофельной цистообразующей нематоды Globodera rostochiensis (Wollenweber) Skarbilovich // Карантин растений. Наука и практика. – 2019. № 4 (30). – С. 9–22.STO VNIIKR 6.001-2010 “Potato cyst nematodes Globodera rostochiensis (Woll.) Behrens and Globodera pallida (Stone) Behrens. Detection and identification methods”. (In Russian.)Basic Local Alignment Seаrch Tool / NCBI. – URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (дата обращения: 03.09.2020).Sudarikova S.V., Ivanov A.V., Khudiakova E.A. PCR Diagnostics to Enhance Detection of Globodera rostochiensis (Wollenweber) Skarbilovich [Sovershenstvovanie PCR-diagnostiki zolotistoy kartofelnoy tsistoobrazuyushey nematody Globodera rostochiensis (Wollenweber) Skarbilovich]. Plant Health. Research and Practice. 2019; 4 (30): 9–22. (In Russian.)Basic Local Alignment Seаrch Tool. NCBI. URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (last accessed: 03.09.2020).Basic Local Alignment Seаrch Tool. NCBI. URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (last accessed: 03.09.2020).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.