phytosanitaryФитосанитария. Карантин растенийPlant Health and Quarantine2782-327X10.69536/FKR.2021.42.76.001phytosanitary-39Research ArticleНАУЧНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯSCIENTIFIC RESEARCHИзучение генетических особенностей возбудителя фомопсиса подсолнечникаStudy of the genetic peculiarities of the causative agent of stem canker of sunflowerhttps://orcid.org/0000-0002-0463-5762СуринаТ. А.SurinaT. A.

Сурина Татьяна Александровна, кандидат биологических наук, начальник – старший научный сотрудник научного отдела молекулярно-генетических методов диагностики, 140150, Россия, Московская обл., г. Раменское, р. п. Быково, ул. Пограничная, 32

Tatyana Surina, PhD in Biology, head and senior researcher of Research Department for Molecular Genetic Methods of Diagnosis, 140150, 32 Pogranichnaya St., Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast, Russia

t.a.surina@yandex.ruСкрипкаО. В.SkripkaO. V.

Скрипка Ольга Валентиновна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник научно-методического отдела микологии и гельминтологии, р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл., Россия

Olga Skripka, PhD in Biology, senior researcher of Research and Methodology Department for Mycology and Helminthology, Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast, Russia

ovskripka@mail.ruРучковЕ. Р.RuchkovE. R.

Ручков Егор Романович, младший научный сотрудник научно-методического отдела микологии и гельминтологии, р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл., Россия

Egor Ruchkov, junior researcher of Research and Methodology Department for Mycology and Helminthology, Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast, Russia

egorruchkov1966@gmail.comФГБУ «Всероссийский центр карантина растений» (ФГБУ «ВНИИКР»)РоссияAll-Russian Plant Quarantine Center (FGBU “VNIIKR”)Russian Federation202107062021014248Copyright © Сурина Т.А., Скрипка О.В., Ручков Е.Р., 20212021Сурина Т.А., Скрипка О.В., Ручков Е.Р.Surina T.A., Skripka O.V., Ruchkov E.R.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://phytosanitary.vniikr.ru/jour/article/view/39

Фомопсис подсолнечника является вредоносным заболеванием в странах, занимающихся промышленным выращиванием семенного и товарного подсолнечника. В последнее десятилетие на подсолнечнике описаны новые для науки виды рода Diaporthe, которые мало отличаются по морфологическим признакам. В связи с этим необходимо разработать молекулярно-генетические методы, которые позволят проводить исследования в сжатые сроки и обеспечат высокую точность идентификации патогена. В процессе работы проведен сбор и анализ имеющейся в мировой практике информации о возбудителе и молекулярно-генетических методах диагностики. Выделен список видов рода Diaporthe, зарегистрированных на подсолнечнике. Определены наиболее вариабельные участки генома.

Stem canker of sunflower is a harmful disease in the countries of industrial cultivation of seed and commercial sunflowers. In the last decade, new species of Diaporthe genus have been described on the sunflower, which have little differences in morphological characteristics. Therefore, it is necessary to develop molecular genetic methods that would allow to conduct research in short terms and provide high accuracy of the pathogen identification. During the study, the data on the pathogen and molecular genetic diagnosis methods available in international practice have been collected and analyzed. A list of species of Diaporthe genus registered on the sunflower has been made. The most variable regions of the genome have been identified.

фомопсис подсолнечникаDiaporthe helianthiмолекулярно-генетический методгенетические особенностинуклеотидная последовательностьstem canker of sunflowerDiaporthe helianthimolecular genetic methodgenetic characteristicsnucleotide sequenceReferencesMasirevic S., Gulya T.J. Sclerotinia and Phomopsis – two devastating sunflower pathogens // Field Crops Research. – 1992. – № 30. – Р. 271–300.Masirevic S., Gulya T.J. Sclerotinia and Phomopsis – two devastating sunflower pathogens // Field Crops Research. 1992; 30: 271–300.Thompson S.M., Tan Y.P., Young A.J., Neate S.M., Aitken E.A.B., Shivas R.G. Stem cankers on sunflower (Helianthus annuus) in Australia reveal a complex of pathogenic Diaporthe (Phomopsis) species // Persoonia. – 2011. – № 27. – Р. 80–89.Thompson S.M., Tan Y.P., Young A.J., Neate S.M., Aitken E.A.B., Shivas R.G. Stem cankers on sunflower (Helianthus annuus) in Australia reveal a complex of pathogenic Diaporthe (Phomopsis) species // Persoonia. 2011; 27: 80–89.Долженко Е.Г. Биология гриба Phomopsis helianthi и меры борьбы с ним в условиях Краснодарского края. Автореферат дисс. канд. биол. наук. Краснодар, Кубан. гос. аграрн. ун-т, 2000. – 25 с.Dolzhenko E.G. Biology of the fungus Phomopsis helianthi and its control measures in Krasnodar Krai [Biologiya griba Phomopsis helianthi i mery bor’by s nim v usloviyakh Krasnodarskogo kraya]. Author’s abstract for the degree of PhD in Biology. Krasnodar, Kuban State Agrarian University, 2000. 25 pp.Пивень В.Т., Алифирова Т.П., Шуляк И.И., Мурадасилова Н.В., Саенко Г.М. Семена подсолнечника – источник сохранения и распространения фомопсиса // Защита и карантин растений. – 2010. – № 1. – С. 36–40Piven V.T., Alifirova T.P., Shulyak I.I., Murasadilova N.V., Saenko G.M. The sunflower seeds as the source of preservation and spreading of phomopsis [Semena podsolnechnika – istochnik sokhraneniya i rasprostraneniya fomopsisa]. Plant protection and quarantine. 2010; 1: 36–40 (in Russian).Гомжина М.М., Ганнибал Ф.Б. Первая находка гриба Diaporthe phaseolorum на подсолнечнике в России. – 2018. – Том 5. – № 1. – С. 59–64.Gomzhina M.M., Gannibal F.B. The first detection of the fungus Diaporthe phaseolorum on sunflower in Russia [Pervaya nakhodka griba Diaporthe phaseolorum na podsolnechnike v Rossii]. Microbilogy Research Independent Journal. 2018; 5–1: 59–64 (in Russian).Carbone I., Kohn L.M. A method for designing primer sets for speciation studies in filamentous ascomycetes // Mycologia. – 1999. – Vol. 91. – № 3. – P. 553–556.Carbone I., Kohn L.M. A method for designing primer sets for speciation studies in filamentous ascomycetes. Mycologia. 1999; 91–3: 553–556.Glass N.L., Donaldson G.C. Development of primer sets designed for use with the PCR to amplify conserved genes from filamentous ascomycetes // Appl. Environ. Microbiol. – 1995. – Vol. 61. – № 4. – P. 1323–1330.Glass N.L., Donaldson G.C. Development of primer sets designed for use with the PCR to amplify conserved genes from filamentous ascomycetes. Appl. Environ. Microbiol. 1995; 61–4: 1323–1330.O’Donnell K. еt al. Multiple evolutionary origins of the fungus causing Panama disease of banana: concordant evidence from nuclear and mitochondrial gene genealogies // Proceedings of the National Academy of Sciences. – 1998. – Vol. 95. – № 5. – P. 2044–2049.O’Donnell K. еt al. Multiple evolutionary origins of the fungus causing Panama disease of banana: concordant evidence from nuclear and mitochondrial gene genealogies. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1998; 95–5: 2044–2049.White T.J., Bruns T., Lee S., Taylor J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics // PCR protocols: a guide to methods and applications. – 1990. – V. 18. – P. 315–322.White T.J., Bruns T., Lee S., Taylor J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. PCR protocols: a guide to methods and applications. 1990; 18: 315–322.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.