phytosanitaryФитосанитария. Карантин растенийPlant Health and Quarantine2782-327X10.69536/v0718-2972-0994-bphytosanitary-123Research ArticleДИАГНОСТИКАDIAGNOSTICSДиагностика вирусов рода BegomovirusDiagnosis of viruses of the genus BegomovirusЛозоваяЕ. Н.LozovayaE. N.

ФГБУ «ВНИИКР»

Researcher, Postgraduate Department

evgeniyaf@mail.ruПриходькоЮ. Н.PrikhodkoY. N.

кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник научно-методического отдела вирусологии и бактериологии

PhD in Agriculture, Leading Researcher, Research and Methodology Department of Virology and Bacteriology

prihodko_yuri59@mail.ruЖиваеваТ. С.ZhivaevaT. S.

научный сотрудник научно-методического отдела вирусологии и бактериологии

Researcher, Research and Methodology Department of Virology and Bacteriology

zhivaeva.vniikr@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7565-1241ШнейдерЮ. А.ShneyderY. A.

кандидат биологических наук, начальник научно-методического и экспериментального центра, ведущий научный сотрудник

PhD in Biology, Head of Research and Methodology and Experimental Center, Leading Researcher

yury.shneyder@mail.ruнаучный сотрудник отдела аспирантурыРоссияFGBU “VNIIKR”Russian FederationФГБУ «ВНИИКР»РоссияFGBU “VNIIKR”Russian Federation202310032023012331Copyright © Лозовая Е.Н., Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А., 20232023Лозовая Е.Н., Приходько Ю.Н., Живаева Т.С., Шнейдер Ю.А.Lozovaya E.N., Prikhodko Y.N., Zhivaeva T.S., Shneyder Y.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://phytosanitary.vniikr.ru/jour/article/view/123

Род Begomovirus – один из наиболее крупных среди родов фитопатогенных вирусов. Представители этого рода заражают двудольные растения и передаются табачной белокрылкой. Ранее этот род был известен также как подгруппа III геминивирусов, или группа вируса золотистой мозаики бобов. Вирус желтой курчавости листьев томата (TYLCV), вирус желтой курчавости листьев томата Сардиния (TYLCSV), вирус курчавости листьев томата Нью-Дели (ToLCNDV) входят в состав рода Begomovirus и являются опасными патогенами овощных культур в открытом и защищенном грунте. Все эти вирусы отсутствуют на территории Российской Федерации, а TYLCV включен в Единый перечень карантинных объектов Евразийского экономического союза (ЕАЭС). Потери урожая томата, перца, цукини и других овощных культур в результате заражения этими патогенами могут достигать 100%. Своевременное выявление зараженных растений имеет важнейшее значение для предотвращения проникновения вирусов на территорию РФ и их распространения на ней. Объективное выявление особо опасных вирусов рода Begomovirus и их идентификация до уровня рода и вида возможны лишь на основе использования современных методов лабораторной диагностики. В ходе исследований авторами статьи протестированы 7 пар универсальных и 4 пары видоспецифичных праймеров для проведения классической полимеразной цепной реакции (ПЦР) и ПЦР в реальном времени. Определены праймеры, позволяющие проводить универсальное выявление комплекса бегомовирусов на овощных культурах. Проведена отработка мультиплексной ПЦР для выявления и идентификации TYLCV и TYLCSV одновременно. Авторами статьи разработаны праймеры, характеризующиеся высокой специфичностью к TYLCV и TYLCSV.

The genus Begomovirus is one of the largest among the genera of phytopathogenic viruses. Representatives of this genus infect dicotyledonous plants and are transmitted by the silverleaf whitefly. Previously, this genus was also known as subgroup III of the geminiviruses, or the Bean golden mosaic virus group. Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), Tomato Yellow Leaf Curl Sardinia Virus (TYLCSV), Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) belong to the genus Begomovirus and are serious pathogens of vegetable crops in open and protected ground. All these viruses are absent on the territory of the Russian Federation, and TYLCV is included in the Common List of Quarantine Pests of the Eurasian Economic Union (EAEU). Yield losses of tomato, pepper, zucchini and other vegetable crops as a result of infection with these pathogens can reach 100%. Timely detection of infected plants is essential to prevent the entry of viruses into the territory of the Russian Federation and their spread on it. Objective detection of especially dangerous viruses of the Begomovirus genus and their identification to the level of genus and species is possible only through the use of modern methods of laboratory diagnostics. During the research, the authors of the article tested 7 pairs of universal and 4 pairs of species-specific primers for classical polymerase chain reaction (PCR) and real-time PCR. Primers have been identified that allow universal detection of the begomovirus complex on vegetable crops. Multiplex PCR was tested to detect and identify TYLCV and TYLCSV simultaneously. The authors of the article developed primers with high specificity for TYLCV and TYLCSV.

Бегомовирусывыявление и идентификацияполимеразная цепная реакциятест-системыпраймерыTYLCVTYLCSVToLCNDVBegomovirusesdetection and identificationpolymerase chain reactiontest systemsprimersTYLCVTYLCSVToLCNDVReferencesAccotto G., Navas-Castillo J., Noris E., Moriones E., Louro D., 2000. Typing of Tomato yellow leaf curl viruses in Europe. – European Journal of Plant Pathology, Vol. 106: 179–186.Accotto G., Navas-Castillo J., Noris E., Moriones E., Louro D., 2000. Typing of Tomato yellow leaf curl viruses in Europe. – European Journal of Plant Pathology, Vol. 106: 179–186.Brown J.K., 2010. Phylogenetic biology of the Bemisia tabaci sibling species group. – In: Bemisia: Bionomics and Management of a Global Pest. Springer, Netherlands: 31–67.Brown J.K., 2010. Phylogenetic biology of the Bemisia tabaci sibling species group. – In: Bemisia: Bionomics and Management of a Global Pest. Springer, Netherlands: 31–67.Brown J., Zerbini F., Navas-Castillo J., Moriones E., Ramos-Sobrinho R., Silva J.C.F., Fiallo-Olivé E., Briddon R.W., Hernández-Zepeda C., Idris A., Malathi V.G., Martin D.P., Rivera-Bustamante R., Ueda S., Varsani A., 2015. Revision of Begomovirus taxonomy based on pairwise sequence comparisons. – Archives of Virology, Vol. 160: 1593–1619.Brown J., Zerbini F., Navas-Castillo J., Moriones E., Ramos-Sobrinho R., Silva J.C.F., Fiallo-Olivé E., Briddon R.W., Hernández-Zepeda C., Idris A., Malathi V.G., Martin D.P., Rivera-Bustamante R., Ueda S., Varsani A., 2015. Revision of Begomovirus taxonomy based on pairwise sequence comparisons. – Archives of Virology, Vol. 160: 1593–1619.Lecoq H., Desbiez C., 2012. Viruses of cucurbit crops in the Mediterranean region: an ever-changing picture. – Adv. Virus Res., Vol. 84: 67–126.Lecoq H., Desbiez C., 2012. Viruses of cucurbit crops in the Mediterranean region: an ever-changing picture. – Adv. Virus Res., Vol. 84: 67–126.Li R., Salih S., Hurtt S., 2004. Detection of geminiviruses in sweetpotato by polymerase chain reaction. – Plant Disease, Vol. 88: 1347–1351.Li R., Salih S., Hurtt S., 2004. Detection of geminiviruses in sweetpotato by polymerase chain reaction. – Plant Disease, Vol. 88: 1347–1351.Naganur P., Premchand U., Shankarappa K.S., Mesta R.K., Manjunatha C., Patil C.V., 2019. Development of a Loop-Mediated Isothermal Amplification assay for detection of Tomato leaf curl New Delhi virus in ridge gourd [Luffa acutangula (L.) Roxb.]. – Int. J. Curr. Microbiol. App. Sci., 8 (9): 2282–2295.Naganur P., Premchand U., Shankarappa K.S., Mesta R.K., Manjunatha C., Patil C.V., 2019. Development of a Loop-Mediated Isothermal Amplification assay for detection of Tomato leaf curl New Delhi virus in ridge gourd [Luffa acutangula (L.) Roxb.]. – Int. J. Curr. Microbiol. App. Sci., 8 (9): 2282–2295.Pellegrin F., Mnari-Hattab M., Tahiri A., Dalleau- Clouet C., Peterschmitt M., Bonato O., 2008. First report of simultaneous presence of Tomato yellow leaf curl Sardinia virus and Tomato yellow leaf curl Israel virus infecting crops and weeds in Tunisia. – Journal of Plant Pathology, Vol. 90: 145.Pellegrin F., Mnari-Hattab M., Tahiri A., Dalleau- Clouet C., Peterschmitt M., Bonato O., 2008. First report of simultaneous presence of Tomato yellow leaf curl Sardinia virus and Tomato yellow leaf curl Israel virus infecting crops and weeds in Tunisia. – Journal of Plant Pathology, Vol. 90: 145.Saison A., Gentit P. Development of a polyvalent detection method for Begomoviruses presenting a threat to the European tomato industry. – TESTA – EPPO Conference on diagnostics for plant pests 30 to 02/12/2015.Saison A., Gentit P. Development of a polyvalent detection method for Begomoviruses presenting a threat to the European tomato industry. – TESTA – EPPO Conference on diagnostics for plant pests 30 to 02/12/2015.Wyatt S., Brown J., 1996. Detection of subgroup III geminivirus isolates in leaf extracts by degenerate primers and polymerase chain reaction. – Phytopathology, Vol. 86: 1288–1293.Wyatt S., Brown J., 1996. Detection of subgroup III geminivirus isolates in leaf extracts by degenerate primers and polymerase chain reaction. – Phytopathology, Vol. 86: 1288–1293.European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) [Электронный ресурс]. – URL: https://gd.eppo.int (дата обращения: 15.11.2022).European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) [Электронный ресурс]. – URL: https://gd.eppo.int (дата обращения: 15.11.2022).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.