phytosanitaryФитосанитария. Карантин растенийPlant Health and Quarantine2782-327X10.69536/a6147-0848-4962-iphytosanitary-111Research ArticleДИАГНОСТИКАDIAGNOSTICSИспытание тест-системы для диагностики Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoriaTesting a test system for the diagnosis of Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoriahttps://orcid.org/0000-0002-3084-0591ПисареваИ. Н.PisarevaI. N.

Писарева Ирина Николаевна, научный сотрудник научно-методического отдела вирусологии и бактериологии

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.

Irina Pisareva, Researcher, Research and Methodology Department of Virology and Bacteriology

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

iruru@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3295-8080ЯремкоА. Б.YaremkoA. B.

Яремко Анастасия Богдановна, младший научный сотрудник научного отдела молекулярно-генетических методов диагностики

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.

Anastasia Yaremko, Junior Researcher, Research Department of Molecular and Genetic Diagnosis Methods

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

an_ya94@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1281-4410ПриходькоС. И.PrikhodkoS. I.

Приходько Светлана Игоревна, научный сотрудник, заведующая лабораторией бактериологии и анализа ГМО ИЛЦ

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.

Svetlana Prikhodko, Researcher, Head of Laboratory of Bacteriology and GMO Analysis, Testing Laboratory Center

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

svetlana.prik@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8198-363XШнейдерЕ. Ю.ShneyderE. YU.

Шнейдер Елена Юрьевна, старший научный сотрудник научно-методического отдела вирусологии и бактериологии

р. п. Быково, г. Раменское, Московская обл.

Elena Shneyder, Senior Researcher, Research and Methodology Department of Virology and Bacteriology

Bykovo, Ramenskoye, Moscow Oblast

seunch@mail.ruФГБУ «Всероссийский центр карантина растений» (ФГБУ «ВНИИКР»)РоссияFGBU “All-Russian Plant Quarantine Center” (FGBU “VNIIKR”)Russian Federation202225082022033744Copyright © Писарева И.Н., Яремко А.Б., Приходько С.И., Шнейдер Е.Ю., 20222022Писарева И.Н., Яремко А.Б., Приходько С.И., Шнейдер Е.Ю.Pisareva I.N., Yaremko A.B., Prikhodko S.I., Shneyder E.Y.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://phytosanitary.vniikr.ru/jour/article/view/111

Черная бактериальная пятнистость томата широ­ко распространена в мире и наносит значительный экономический ущерб при выращивании томата и перца. Диагностика осложнена тем, что заболе­вание вызывается четырьмя видами бактерий рода Xanthomonas. Основным путем распространения бактериоза на дальние расстояния являются семе­на. Европейская и Средиземноморская организа­ция по карантину и защите растений (ЕОКЗР) включила группу возбудителей черной бактериальной пятнистости в Список А2 перечня карантинных объектов. Выявление и идентификация фитопато­генов на всех этапах производства томата и перца позволят вовремя принять меры по защите расте­ний, что в значительной степени снизит потери урожая и повысит экономическую эффективность производства отечественных овощей. Существую­щие схемы диагностики болезни подразумевают большие трудозатраты и длительный срок прове­дения исследований, что неприемлемо в рутинной лабораторной диагностике. В статье представле­ны результаты исследований диагностики одного из возбудителей черной бактериальной пятнисто­сти (X. euvesicatoria pv. euvesicatoria). Для установ­ления степени влияния растительной матрицы на конечные результаты исследований образцов нами был проведен ряд опытов по искусственному заражению X. euvesicatoria pv. euvesicatoria экстрактов вегетативных частей и семян томата. В ходе испытания методики подготовки проб с дальнейшим выделением ДНК и ПЦР-анализом искусственно зара­женных образцов установлено, что ингибирования ПЦР не происходит. Аналитическая чувствитель­ность тест-системы для диагностики X. euvesicatoria pv. euvesicatoria производства ООО «АгроДиагности­ка» составила 103 КОЕ/мл. Исследования проведены на базе ФГБУ «ВНИИКР».

Bacterial spot of tomato is worldwide spread and causes significant economic damage in tomato and pepper cultivation. Diagnosis is complicated by the fact that the disease is caused by four types of bacteria of the genus Xanthomonas. Seeds are the main pathway for bacteriosis over long distances. The European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) has included a group of causative agents of black bacterial spot in List A2 of the List of Quarantine Objects. Detection and identification of phytopathogens at all stages of tomato and pepper cultivation will allow taking timely measures to protect plants, which will significantly reduce crop losses and increase the economic efficiency of domestic vegetable production. Existing schemes for diagnosing the disease imply large labor costs and a long period of research, which is unacceptable in routine laboratory diagnosis. The article presents the results of studies on the diagnosis of one of the pathogens of black bacterial spot (X. euvesicatoria pv. euvesicatoria). To establish the degree of influence of the plant matrix on the final results of the samples study, we conducted a series of experiments on artificial infection with X. euvesicatoria pv. euvesicatoria of extracts of tomato vegetative parts and seeds. In the course of testing the sample preparation technique with further DNA isolation and PCR analysis of artificially infected samples, it was found that PCR inhibition does not occur. Analytical sensitivity of the diagnostic test system for X. euvesicatoria pv. euvesicatoria produced by AgroDiagnostics was 103 cfu/ml. The studies were carried out on the basis of FGBU “VNIIKR”.

черная бактериальная пятнистость томатафитопатогенвыявление и идентификацияПЦРаналитическая чувствительностьингибиторыbacterial spot of tomatophytopathogendetection and identificationPCRanalytical sensitivityinhibitorsReferencesАхатов А. Мир томата глазами фитопатолога. 3-е изд., испр. и доп. – М.: Тов-во науч. изданий «КМК», 2016, 292 с.Akhatov A. The world of tomato through the eyes of a phytopathologist [Mir tomata glazami fitopa­tologa]. 3rd ed., rev. and additional. M.: Tov-in scientific. editions of KMK, 2016, 292 p. (in Russian).Белошапкина О. и др. Защита растений: фитопатология и энтомология. – Ростов н/Д: Феникс, 2017, 478 с.Beloshapkina O. et al. Plant protection: phytopathology and entomology [Zashchita rasteniy: fito­patologiya i entomologiya]. Rostov n/a: Phoenix, 2017, 478 p. (in Russian).Иванцова Е., 2017. Болезни томата в Нижневолжском регионе. – Фермер. Поволжье, № 2: 80–82.Ivantsova E. Tomato diseases in the Lower Volga region [Bolezni tomata v Nizhnevolzhskom regione]. Farmer. Volga Region, 2017; 2: 80–82 (in Russian).Нетрусов А. и др. Практикум по микробиологии. – М.: Академия, 2005, 571 с.Netrusov A. et al. Workshop on microbiology [Praktikum po mikrobiologii]. M.: Academy, 2005, 571 p. (in Russian).Шнейдер Е., Шнейдер Ю., 2020. Систематизация перечня и категоризация вредных орга­низмов, связанных с импортированием, экспортированием и перемещением семян пасленовых культур. – НИР, ФГБУ «ВНИИКР», 147 с.Shneyder E., Shneyder Yu. Systematization of the list and categorization of pests associated with the import, export and movement of seeds of Solanaceae crops [Sistematizatsiya perechnya i kategorizatsiya vred­nykh organizmov, svyazannykh s importirovaniyem, ek­sportirovaniyem i peremeshcheniyem semyan paslenovykh kultur]. Research, FGBU “VNIIKR”, 2020, 147 p.EPPO, 2013. PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper. – Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 43 (1): 7–20.EPPO. PM 7/110 (1) Xanthomonas spp. (Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas vesicatoria) causing bacterial spot of tomato and sweet pepper. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 2013; 43 (1): 7–20.Fatmi M., Walcott R., Schaad N. Detection of Plant-Pathogenic Bacteria in Seed and Other Planting Material, Second Edition. – Minnesota: The American Phytopathological Society (APS), 2017, 360 p.Fatmi M., Walcott R., Schaad N. Detection of Plant-Pathogenic Bacteria in Seed and Other Planting Material, Second Edition. Minnesota: The American Phytopathological Society (APS), 2017, 360 p.ISF, 2017. Method for the detection of Xanthomonas spp. in Tomato seed. – URL: https://worldseed.org/wp-content/uploads/2022/01/2017_Protocol_Tomato_Xanthomonas_spp_v5.pdf (дата обращения: 30.06.2022).ISF, 2017. Method for the detection of Xanthomonas spp. in Tomato seed. URL: https://worldseed.org/wp-content/uploads/2022/01/2017_Protocol_Tomato_Xanthomonas_spp_v5.pdf (last accessed: 30.06.2022).Potnis N., Timilsina S., Strayer A., Shantharaj D., Barak J., Paret M., Vallad G., Jones J., 2015. Bacterial spot of tomato and pepper: diverse Xanthomonas species with a wide variety of virulence factors posing a worldwide challenge. – Molecular Plant Pathology, 16 (9): 907–920.Potnis N., Timilsina S., Strayer A., Shantharaj D., Barak J., Paret M., Vallad G., Jones J. Bacterial spot of tomato and pepper: diverse Xanthomonas species with a wide variety of virulence factors posing a world­wide challenge. Molecular Plant Pathology, 2015; 16 (9): 907–920.Roach R., Mann R., Gambley C., Shivas R., Rodoni B., 2018. Identification of Xanthomonas species associated with bacterial leaf spot of tomato, capsicum and chilli crops in eastern Australia. – European Jour­nal of Plant Pathology, 150 (3): 595–608.Roach R., Mann R., Gambley C., Shivas R., Rodoni B. Identification of Xanthomonas species associated with bacterial leaf spot of tomato, capsicum and chilli crops in eastern Australia. European Journal of Plant Pa­thology, 2018; 150 (3): 595–608.Анализ рынка томатов в России в 2016–2020 гг. Оценка влияния коронавируса и прогноз на 2021–2025 гг. [Электронный ресурс]. – URL: https://businesstat.ru/catalog/id8248 (дата обра­щения: 30.09.2021).Analysis of the tomato market in Russia in 2016–2020. Coronavirus impact assessment and forecast for 2021–2025 [Electronic resource]. URL: https://businesstat.ru/catalog/id8248 (last accessed: 30.09.2021).CABI. Invasive Species Compendium. – URL: https://www.cabi.org/isc (дата обращения: 30.06.2022).CABI. Invasive Species Compendium. URL: https://www.cabi.org/isc (last accessed: 30.06.2022).EPPO Global Database. – URL: https://gd.eppo.int (дата обращения: 30.06.2022).EPPO Global Database. URL: https://gd.eppo.int (last accessed: 30.06.2022).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.